Národní referenční laboratoř pro mykologickou diagnostiku
NRL pro mykologickou diagnostiku při Zdravotním ústavu se sídlem v Ostravě byla zřízena Ministerstvem zdravotnictví České republiky (MZČR) ke dni zveřejnění informace ve Věstníku MZČR 31. 5 2022. Specializované pracoviště NRL pro mykologickou diagnostiku se zabývá řešením problematiky mykotických infekcí v rozsahu:
- sledování epidemiologické situace výskytu klinicky významných izolátů mikroskopických hub (např. kvasinek z hemokultur, vláknitých hub v dolních cestách dýchacích, trendy výskytu antropofilních, zoofilních a geofilních dermatofytů) v ČR,
- sledování výskytu kryptických a raritních druhů mikromycetů, původců mykotických onemocnění v ČR ve spolupráci s NRL pro antimykotika,
- edukace a spolupráce s rutinními laboratořemi (doporučení metod, postupů pro identifikace mikromycetů, kultivačních médií, seznámení s epidemiologickou situací v ČR apod.),
- další výzkumná činnost – zdokonalování molekulárních metodik průkazu DNA, druhové identifikace mykotického agens přímo z klinického materiálu a včasné diagnostiky invazivních a chronických mykotických infekcí s využitím fungálních biomarkerů,
- koordinace, podíl na přípravě a příprava okružních vzorků pro Externí hodnocení kvality (EHK) laboratoří v rozsahu EHK pro Mykologickou diagnostiku (č. 1255), Kultivaci a identifikaci vláknitých hub (č. 1273).
NRL zajišťuje následující služby:
Konfirmace rodové a druhové identifikace nálezů z klinického materiálu
- Možnost konfirmace identifikace kvasinek z významných klinických materiálů (např. z hemokultur) s využitím pokročilých kultivačních technik a sekvenace LSU rDNA
- Možnost konfirmace identifikace klinických nálezů kvasinkovitých a vláknitých mikromycetů z klinického materiálu (např. tkáně, likvoru, bronchoalveolární tekutiny apod., s využitím pokročilých kultivačních technik a sekvenace oblastí ITS, LSU a ß-tubulinu)
- Možnost konfirmace identifikace dermatofytů s využitím pokročilých kultivačních technik, širšího spektra kultivačních médií a sekvenace ITS1-4 rDNA zaslaného kmene a analýza klinického vzorku přímou detekcí DNA metodou PCR
Přímá diagnostika importovaných endemických mykóz
- Analýza klinického vzorku mikroskopicky, kultivačně, přímou detekcí DNA ve vzorku, podrobná identifikace suspektních klinických vzorků a kmenů kultivovaných z klinického materiálu (s využitím sekvenace oblastí ITS a LSU rDNA)
Nepřímá diagnostika mykotických infekcí
- Možnost konfirmace standardně používaných mykotických biomarkerů (koncentrace galaktomananu v séru a bronchoalveolární laváži, 1,3-ß-D-glukanu v séru referenční metodou, průkaz glukuronoxylomananového antigenu v séru, likvoru a moči metodou LFA)
- Možnost průkazu specifických Ig A, G a M proti Aspergillus fumigatus a Candida albicans spolu se stanovením avidity IgG proti A. fumigatus, které se mohou diagnosticky uplatnit v diferenciální diagnostice aspergilózy
Výstupem výše zmíněných činností jsou autorské a spoluautorské publikace, které rozvíjejí přístupy k diagnostice mykotických infekcí a další literární přehledy získaných dat:
- Dobias, R.; Jaworska, P.; Tomaskova, H.; Kanova, M.; Lyskova, P.; Vrba, Z.; Holub, C.; Svobodová, L.; Hamal, P.; Raska, M. Diagnostic value of serum galactomannan, (1,3)-ß-d-glucan, and Aspergillus fumigatus-specific IgA and IgG assays for invasive pulmonary aspergillosis in non-neutropenic patients. Mycoses 2018, 61, 576-586, doi:10.1111/myc.12765.
- Dobiáš, R.; Kantorová, M.; Jaworská, P.; Hamal, P.; Mrázek, J. Využití PCR-HRMA při přímé detekci a identifikaci původců dermatofytóz z klinických vzorků. Ces. Slov. Derm. 2018, 93.
- Hubka, V.; Čmoková, A.; Peano, A.; Větrovský, T.; Dobiáš, R.; Mallátová, N.; Lysková, P.; Mencl, K.; Janouškovcová, H.; Stará, J. Zoonotické dermatofytózy: klinický obraz, diagnostika, etiologie, léčba, epidemiologická situace u nás. Ces. Slov. Derm. 2018, 93.
- Kocmanová, I.; Lysková, P.; Chrenková, V.; Olišarová, P.; Dobiáš, R.; Janouškovcová, H.; Soukupová, H.; Mallátová, N.; Svobodová, L.; Hamal, P., et al. Nosocomial candidemia in the Czech Republic in 2012–2015: results of a microbiological multicentre study. Epidemiol. Mikrobiol. Imunol. 2018, 67, 3-10.
- Lysková, P.; Dobiáš, R.; Kuklová, I.; Mallátová, N.; Čmoková, A.; Kolařík, M.; Vojtíšková, V.; Karpetová, L.; Hubka, V. Pět případů lidských dermatofytóz vyvolaných zoofilním druhem Trichophyton erinacei přeneseným z ježků. Čes-slov. Derm 2018, 6, 237-243.
- Dobias, R.; Filip, M.; Vragova, K.; Dolinska, D.; Zavodna, P.; Dujka, A.; Linzer, P.; Jurek, P.; Studena, B.; Cerna, E., et al. Successful surgical excision of cerebral abscess caused by Fonsecaea monophora in an immunocompetent patient and review of literature. Folia microbiologica 2019, 64, 383-388, doi:10.1007/s12223-018-0661-9.
- Káňová, M.; Dobiáš, R.; Liszková, K.; Frelich, M.; Ječmínková, R.; Kula, R. Presepsin in the diagnostics of sepsis. Vnitrni lekarstvi 2019, 65, 497-505.
- Dobiáš, R.; Havlíček V. Chromoblastomykózy a feohyfomykózy – patogeneze a laboratorní diagnostika. Klin. Mikrobiol. Inf. Lek. 2020, 26, 69-75.
- Dobiáš, R.; Havlíček V. Chromoblastomykózy a feohyfomykózy, výskyt opomíjených mykotických onemocnění. Klin. Mikrobiol. Inf. Lek. 2020, 26, 54-61.
- Lysková, P.; Dobiáš, R.; Čmoková, A.; Kolařík, M.; Hamal, P.; Šmatláková, K.; Hušek, J.; Mencl, K.; Mallátová, N.; Poláčková, Z. An Outbreak of Trichophyton quinckeanum Zoonotic Infections in the Czech Republic Transmitted from Cats and Dogs. Journal of Fungi 2021, 7, 684, doi:10.3390/jof7090684.
- Dobiáš, R.; Káňová, M.; Petejová, N.; Pisti, Š.K.; Bocek, R.; Krejčí, E.; Stružková, H.; Cachová, M.; Tomášková, H.; Hamal, P., et al. Combined Use of Presepsin and (1,3)-β-D-glucan as Biomarkers for Diagnosing Candida Sepsis and Monitoring the Effectiveness of Treatment in Critically Ill Patients. Journal of Fungi 2022, 8, 308.
Kontakt
Mgr. Radim Dobiáš, Ph.D. – vedoucí NRL
radim.dobias@zuova.cz
+ 420 596 200 239
Partyzánské náměstí 2633/7
Moravská Ostrava
702 00 Ostrava
Aktuality
Odběry vzorků na konci roku 2024
Termíny pro letošní výsledky analýz vzorků.
Nabídka zaměstnání
Prohlédněte si nové pracovní nabídky
Evropský testovací týden
Poradny Zdravotního ústavu se sídlem v Ostravě se připojí k Evropskému testovacímu týdnu HIV a rozšíří provozní dobu.
XI. česko-slovenská konference "Doprava, zdraví a životní prostředí"
Ve dnech 8. až 9. října jsme se zúčastnili XI. Česko-slovenské konference „Doprava, zdraví a životní prostředí“ v Pasohlávkách.
Znovuotevření pracoviště v Opavě
Od 29. 10. 2024 opět otevíráme pracoviště v Opavě na ulici Olomoucká 1208/80.
Zobrazit všechny aktuality
Termíny pro letošní výsledky analýz vzorků.
02.12.2024
Nabídka zaměstnání
Prohlédněte si nové pracovní nabídky
29.11.2024
Evropský testovací týden
Poradny Zdravotního ústavu se sídlem v Ostravě se připojí k Evropskému testovacímu týdnu HIV a rozšíří provozní dobu.
05.11.2024
XI. česko-slovenská konference "Doprava, zdraví a životní prostředí"
Ve dnech 8. až 9. října jsme se zúčastnili XI. Česko-slovenské konference „Doprava, zdraví a životní prostředí“ v Pasohlávkách.
04.11.2024
Znovuotevření pracoviště v Opavě
Od 29. 10. 2024 opět otevíráme pracoviště v Opavě na ulici Olomoucká 1208/80.
24.10.2024
Zobrazit všechny aktuality